免疫沉淀实验流程目前主要有两种不同的ChIP实验方法：
1.2 Cross-liking Chromatin Immunoprecitation (交联染色质免疫沉淀，X-ChIP)
1.甲醛处理细胞，使 DNA-protein 的相互结合作用被交联固定。
2.裂解细胞，得到全细胞裂解液。
3.超声处理，将基因组 DNA 打断至 100-500bp。
4.抗体免疫沉淀：在细胞裂解液中加入一抗和 beads，并进行孵育。
5.采用合适的实验条件进行洗脱，并解交联。
6.通过 qPCR 对 ChIP 结果进行验证。
7.准备好的 ChIP 后的 DNA 样品可以用于 ChIP Sequencing 建库。
1.1 Native Chromatin Immunoprecipitation (自然染色质免疫沉淀，N-ChIP)
1.通过非变性的方式得到核裂解液。
2.微球菌核酸酶（Micrococcal nuclease）消化染色质，得到单核小体或核小体寡聚体。
3.抗体免疫沉淀：在细胞裂解液中前后加入一抗和 beads，并进行孵育。
4. DNA 分离。
5.通过 qPCR 对 ChIP 结果进行验证。
6.准备好的 ChIP 后的 DNA 样品可以用于 ChIP Sequencing 建库。
