自噬的本质其实是细胞内的膜重排，其发生过程大体分为以下4个阶段：自噬的起始→ 隔离膜和自噬体的形成→ 自噬体与溶酶体融合→ 自噬体的裂解。
图1. 自噬的发生过程
（Li et al. Molecular Cancer, 2020）
在自噬的发生过程中，有多种自噬相关蛋白可调节和控制自噬形成的不同阶段。迄今为止，科学家已在酵母中鉴定出40余个编码ATG蛋白的基因，并且大多数在酵母和哺乳动物之间高度保守。在哺乳动物细胞中，饥饿诱导的自噬大约受20种核心ATG基因调节，它们在液泡附近被不断募集，并组装形成自噬前体。这些基因的分类和作用如下：
图2. 自噬相关基因及其在自噬中的蛋白质功能
（Li et al. Molecular Cancer, 2020）
细胞基础水平的自噬活性很低，不适于观察，因此，对自噬研究多需人工干预。目前常用的自噬激动剂有Rapamycin和EBSS等，常用的自噬抑制剂有Chloroquine、3-MA、NH4Cl和 Bafilomycin A1等。这些自噬激动剂和抑制剂可以分别激活/抑制自噬发生的不同阶段，可以根据实验需要选择合适的激动剂或抑制剂。
图3. 自噬通路调控药物
（Lorenzo Galluzi et al. Nat Rev Drug Discov, 2017）
