线粒体是真核细胞的能量中心,广泛参与许多细胞生物学过程,需要多层质量控制系统来确保其功能正常,从而维持细胞和有机体的稳态。那么关于线粒体稳态有什么课题设计思路呢?今天我们一起来探讨一下。
接下来我们将分享一篇发表于中科院1区期刊developmental cell,影响因子为10.7的文献,希望能给大家带来不一样的灵感。
一、文章信息
二、研究背景
①许多人类疾病与线粒体结构异常与能量缺乏、异常分布和自噬转换受损有关。就像金发姑娘和三只熊的故事一样,线粒体需要“恰到好处”,不能太小,也不能太大。
②MitoSafe可防止有害的极端融合,这种融合会损害线粒体外膜和内膜的呼吸功能。在细胞膜外,Parkin、磷酸化Parkin和泛素的PINK1促进Mfn1和Mfn2的蛋白酶体降解。
③在细胞膜内,Oma1切割Opa1并抑制内膜融合。在MitoSafe中,Oma1通过反复、短暂的内膜电位下降(称为闪烁)被激活,而不会失去整个膜电位。
④在高灌注的线粒体中,闪烁的频率大大加快。因此,MitoSafe可以被认为是闪烁功能的关键生物过程。然而,目前尚不清楚延长的线粒体是如何引起闪烁的。
三、技术路线
四、研究结果
1.基于活细胞成像的RNA干扰筛选发现Slc25a3对Drp1-KO细胞的闪烁至关重要
为了探究线粒体闪烁的机制,研究团队根据线粒体蛋白质组(MitoCarta3.0)选择了30个线粒体基因,敲除了30个选定的基因后,进行膜电位检测,结果如图1A~C所示,大约60%~70%的Drp1-KO细胞表现出闪烁,通过细胞闪烁评分选定Ccdc51、Mpv17、Slc25a3和Slc25a40。接着,分别敲除Drp1-KO mef中的候选基因并测定其闪烁频率,图1D显示Slc25a3的敲除可以显著降低Drp1-KO mef中闪烁的频率。随后团队使用CRISPR技术敲除了Drp1-KO mef中的Slc25a3,从图1E可以发现Slc25a3的KO显著降低了Drp1-KO mef中的闪烁频率,然而图1F显示Drp1Slc25a3-KO细胞维持与Drp1-KO mef相似的膜电位。表明Slc25a3不影响线粒体膜电位,而在Drp1-KO细胞线粒体低灌注时促进闪烁的机制中发挥重要作用。
2.Slc25a3对于增强Drp1-KO细胞中Opa1的切割很重要
接着,他们就Slc25a3如何在这一机制中发挥作用进行了深入探索。现有研究证明,细胞膜内Oma1切割Opa1并抑制内膜融合。图2A~B显示Oma1介导的Opa1切割在Drp1-KO细胞中增强。与Drp1-KO MEFs相比,Drp1Slc25a3-KO MEFs中L1和L2的水平显著升高。而Drp1-KO mef中Mfn1和Mfn2水平的降低在Drp1Slc25a3-KO mef中没有恢复。表明Slc25a3对于增强Drp1-KO mef中Opa1长异构体的加工至关重要。此外,两种Drp1受体Mff和Fis1的水平在缺乏Drp1或Slc25a3时不受影响。另一种Drp1受体Mid49在Drp1-ko mef或Drp1Slc25a3-KO mef中升高。
如果Oma1对L1和L2的切割减少,预计它们的切割产物S3和S5的水平可能会降低。然而,图2A~B的Drp1Slc25a3-KO mef中并未表现出这一点。通过诱导Opa1-L2-HA在短时间内的表达,结果如图2C~D,发现Slc25a3的缺失显著降低了Opa1 L2-HA向S5-HA的转化。表明Slc25a3对于Drp1-KO细胞中Opa1的切割至关重要。
3.Slc25a3和Drp1的同时缺失会产生巨粒线粒体和聚集线粒体DNA(mtDNA)
此外,在图3A~3C中,团队观察到在Drp1-KO mef中,线粒体被拉长并形成球形结构。在Slc25a3-KO mef中,线粒体形态正常。且与Drp1-KO mef相比,Drp1Slc25a3-KO mef中球形线粒体的频率和大小都显著增加。虽然在光镜下,Slc25a3-KO MEFs的线粒体形态似乎没有受到影响,但图3D电镜结果显示,线粒体的线粒体超微结构发生了显著变化。在Slc25a3-KO mef中,内膜嵴大量缺失,仅发现短而罕见的嵴结构。在Drp1-KO mef中,延长的线粒体维持了正常的嵴结构。这些结构缺陷在单ko mef中被合并到双ko mef中。在Drp1Slc25a3-KO mef中,发现线粒体伸长和增大,但没有大部分嵴。
明确了Slc25a3和Drp1对线粒体形态的影响后,团队进一步探索了其对mtDNA的作用,团队先使用mitotracker检测mtDNA,发现在WT和Slc25a3-KO mef中,mtDNA信号沿线粒体小管存在。如图4A~C所示,在Drp1Slc25a3-KO mef中,线粒体管状部分的mtDNA信号几乎完全丢失,大部分mtDNA聚集在线粒体增大的球形部分。图4D显示,这些数据表明Drp1和Slc25a3协同维持mtDNA的分布。接着使用携带mUNG1(Y147A)突变的质粒转染细胞消除mtDNA。图4E~4J能看到mtDNA的缺失显著降低了Drp1-KO和Drp1Slc25a3-KO MEFs中含有球形线粒体的细胞百分比和球形线粒体的大小。而据图4K所示,闪烁频率不受mtDNA去除的影响。综上,mtDNA的聚集有助于Drp1-KO和Drp1Slc25a3-KO细胞线粒体大小的增加,但不是闪烁,可能是通过物理堵塞和膨胀的线粒体小管。
4.Drp1和Slc25a3缺失对氧化磷酸化和糖酵解的影响
为了探究Drp1和Slc25a3缺失对线粒体功能的影响,他们对细胞耗氧率(ocr)和胞外酸化率(ecar)进行了测定,结果如图5A~B所示,Drp1或Slc25a3的个体缺失降低了ocr,它们的同时缺失进一步降低了基础和最高水平的ocr。这些叠加效应表明Drp1和Slc25a3在线粒体呼吸中的作用是不同的。在图5C~D中,与ocr相比,Drp1-KO、Slc25a3KO和Drp1Slc25a3-KO MEFs的基础ecar增加。然而在图5D中能看到三组所有细胞的糖酵解储备减少,但糖酵解能力没有明显变化。综上,Drp1和Slc25a3缺失影响氧化磷酸化和糖酵解。
5.slc25a3介导的铜转运对Drp1-KO细胞的闪烁、Opa1加工和线粒体形态至关重要
最近的研究表明,Slc25a3除了运输磷酸盐外,还运输铜。在Slc25a3中引入了阻止铜和磷酸盐H75A或特异性磷酸盐的L175A突变。如图5E显示,Slc25a3(H75A)在铜和磷酸盐的运输中都有缺陷,但未能挽救Drp1Slc25a3-KO mef中减少的闪烁。相比之下,图5E中的Slc25a3 (L175A)在Drp1Slc25a3-KO mef中仅存在磷酸盐运输缺陷,其闪烁频率显著增加,与WT相似。而在图5F中,Cu-ATSM处理有效地增加了Drp1Slc25a3-KO mef的闪烁率。同样的,图5G的原子吸收光谱证实,铜转运到线粒体的减少降低了Drp1Slc25a3-KO mef的闪烁率。
在图5H~I中能看到WT和Slc25a3(L175A)恢复了Drp1Slc25a3-KO MEFs中的Opa1加工并降低了L1和L2水平,然而不能恢复Drp1Slc25a3-KO MEFs中Mfn1和Mfn2的降低。综上,Slc25a3转运铜在Drp1-KO细胞的闪烁和Opa1加工中起着至关重要的作用。
此外,在图6D中能看到L175A突变体挽救了Slc25a3-KO细胞的嵴结构,而H75A突变体则没有。图6E~6G中的L175A突变体完全恢复了Slc25a3-KO细胞的基础和最大ocr,而H75A突变体没有恢复基础ocr,只是部分增加了最大ocr。综上,Slc25a3的铜转运活性对维持嵴结构和线粒体呼吸至关重要。
6.铜结合酶SOD1和COX以相反的方式控制闪烁
人类Slc25a3缺陷导致致命的线粒体缺陷,并伴有乳酸酸中毒、肥厚性心肌病和新生儿张力低下的症状。在第一个跨膜a-螺旋中引入了疾病相关的G72E突变。能在图7J~K中看到,WT人Slc25a3在Drp1Slc25a3-KO mef中挽救了Opa1的切割,而Slc25a3(G72E)没有,尽管它们的表达水平相似。而图7L的分离线粒体的原子吸收光谱分析显示,Slc25a3(G72E)不能补充Drp1Slc25a3-KO MEFs中的线粒体铜水平。总之,致病性G72E突变损害了人类Slc25a3的铜转运活性,从而影响了其在维持线粒体结构和功能中的关键作用。
五、研究小结
本研究揭示了线粒体铜由Slc25a3转运,在线粒体高灌注时通过抑制融合来调节线粒体融合与分裂的平衡。首先作者通过基因筛选发现Slc25a3缺失显著降低Drp1KO细胞的闪烁频率;并进一步证实了Slc25a3铜转运在Drp1-KO细胞的闪烁和Opa1加工中起着至关重要的作用,以及Drp1缺失的情况下,Slc25a3铜转运对线粒体形态和能量代谢以及mtDNA分布的影响;同时还揭示了铜转运控制闪烁的机制。最后得出结论:线粒体铜由Slc25a3转运,在线粒体高灌注时通过抑制融合来调节线粒体融合与分裂的平衡。铜的这种功能是由两种含铜酶介导的:铜依赖酶SOD1抑制闪烁,COX促进闪烁来影响闪烁。
六、国自然中标情况