提高磷酸钙转染法效率的共通步骤，目的都是为了避免产生会被细胞内吞、加工失效的大颗粒沉淀。
提高转染效率的操作有以下这些：
1、将小分子DNA整合在高分子质量基因组DNA上，以大分子作为运载体，能提高转染效率。
2、测试缓冲液适合的ph，可制备几批pH范围为6.90～7.15的HEPES盐缓冲液，分别测试缓冲效率，找到最适pH值。
3、使用转染促进剂，如甘油、氯喹、其他可购买的转染促进剂。因为这些试剂对细胞有一定毒性，因此，应针对每种细胞系通过实验确定转染促进剂处理的最佳时机、时长和强度。
除了这些共通的步骤，不同厂家还会对混匀DNA和磷酸钙的速度有要求。有些方法要求只能轻轻搅动，有些建议用移液器温和吹吸混匀，有些则提倡应缓慢混合。
因此，在使用磷酸钙转染时，应针对不同试剂和细胞系，耐心调整实验参数，才是获得高转染效率的关键。
