细胞内亮的小泡泡通常是指细胞内的气泡，它们可能是由氧气、二氧化碳或其他气体构成。细胞内的气泡可能是由细胞呼吸过程产生的，也可能是由其他因素导致的。例如，细胞内氧气浓度过高或细胞内pH值发生变化时，可能会产生气泡。细胞内的气泡可能会对细胞的正常功能产生影响，因此需要进行相应的观察和控制。
一部分情况下细胞内小亮点是细胞内黑色颗粒或者一些粘附在细胞表面的碎片，这种黑点会在调整显微镜焦距时呈小黑点或者小亮点，容易被误认为细胞内小泡，其实只是细胞内部或表面一些物质折光形成的光学现象。也有些是细胞内部脂滴，例如3T3-L1细胞在部分培养条件下可以明显看到内部脂滴，染色后更加清晰。
部分细胞在培养时确实可能会有空泡，可以参考细胞库照片比对。若细胞突然出现细胞内空泡增多现象，通常是细胞受到压力的表现，原因可能是培养基中缺乏谷氨酰胺、添加抗真菌剂、不适当的CO2环境对培养基中碳酸氢钠浓度影响或培养基的营养消耗殆尽。
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